Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHX16O60231 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHX16O60231 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHX16O60231 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHX16O60231 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHX16O60231 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHX16O60231 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHX16O60231 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHX16O60231 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHX16O60231 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHX16O60231 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHX16O60231 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHX16O60231 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHX16O60231 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DHX16O60231 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHX16O60231 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHX16O60231 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHX16O60231 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHX16O60231 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHX16O60231 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHX16O60231 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHX16O60231 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHX16O60231 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHX16O60231 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHX16O60231 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHX16O60231 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHX16O60231 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DHX16O60231 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX16O60231 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DHX16O60231 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DHX16O60231 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DHX16O60231 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DHX16O60231 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DHX16O60231 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DHX16O60231 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DHX16O60231 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DHX16O60231 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DHX16O60231 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DHX16O60231 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DHX16O60231 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DHX16O60231 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DHX16O60231 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DHX16O60231 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DHX16O60231 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DHX16O60231 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DHX16O60231 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DHX16O60231 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DHX16O60231 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DHX16O60231 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DHX16O60231 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DHX16O60231 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DHX16O60231 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DHX16O60231 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DHX16O60231 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DHX16O60231 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DHX16O60231 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DHX16O60231 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DHX16O60231 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DHX16O60231 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms