Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms