Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP17L12C9JPN9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms