Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZMYND8Q9ULU4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms