Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSR3Q9UJK0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms