Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIV1

CNOT7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT7Q9UIV1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT7Q9UIV1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT7Q9UIV1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT7Q9UIV1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT7Q9UIV1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT7Q9UIV1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT7Q9UIV1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT7Q9UIV1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT7Q9UIV1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT7Q9UIV1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT7Q9UIV1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT7Q9UIV1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT7Q9UIV1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms