Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MLH3Q9UHC1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms