Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms