Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CCDC180Q9P1Z9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CCDC180Q9P1Z9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms