Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDE1Q9NZC3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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