Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZCCHC17Q9NP64 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC17Q9NP64 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms