Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NYXQ9GZU5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NYXQ9GZU5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms