Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms