Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms