Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms