Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SLC4A9Q96Q91 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A9Q96Q91 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A9Q96Q91 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A9Q96Q91 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A9Q96Q91 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A9Q96Q91 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A9Q96Q91 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A9Q96Q91 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A9Q96Q91 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A9Q96Q91 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A9Q96Q91 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms