Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms