Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTLL11Q8NHH1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms