Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms