Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms