Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms