Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms