Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB3L3Q68CJ9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3L3Q68CJ9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms