Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms