Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf53Q5VUE5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1orf53Q5VUE5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1orf53Q5VUE5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf53Q5VUE5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf53Q5VUE5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf53Q5VUE5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf53Q5VUE5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf53Q5VUE5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms