Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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FAM78BQ5VT40 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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FAM78BQ5VT40 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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FAM78BQ5VT40 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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FAM78BQ5VT40 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM78BQ5VT40 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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