Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC93Q567U6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms