Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HFEQ30201 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HFEQ30201 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HFEQ30201 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HFEQ30201 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HFEQ30201 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HFEQ30201 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HFEQ30201 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HFEQ30201 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HFEQ30201 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HFEQ30201 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HFEQ30201 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HFEQ30201 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HFEQ30201 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HFEQ30201 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HFEQ30201 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HFEQ30201 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HFEQ30201 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HFEQ30201 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HFEQ30201 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HFEQ30201 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HFEQ30201 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HFEQ30201 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HFEQ30201 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HFEQ30201 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HFEQ30201 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HFEQ30201 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HFEQ30201 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HFEQ30201 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HFEQ30201 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HFEQ30201 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HFEQ30201 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HFEQ30201 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HFEQ30201 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HFEQ30201 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HFEQ30201 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HFEQ30201 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HFEQ30201 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HFEQ30201 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HFEQ30201 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HFEQ30201 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HFEQ30201 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HFEQ30201 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HFEQ30201 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HFEQ30201 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HFEQ30201 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HFEQ30201 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HFEQ30201 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HFEQ30201 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HFEQ30201 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HFEQ30201 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HFEQ30201 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HFEQ30201 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HFEQ30201 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HFEQ30201 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HFEQ30201 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HFEQ30201 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HFEQ30201 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HFEQ30201 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms