Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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