Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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COL19A1Q14993 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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COL19A1Q14993 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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COL19A1Q14993 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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COL19A1Q14993 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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COL19A1Q14993 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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COL19A1Q14993 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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COL19A1Q14993 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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COL19A1Q14993 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
COL19A1Q14993 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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COL19A1Q14993 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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COL19A1Q14993 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL19A1Q14993 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL19A1Q14993 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL19A1Q14993 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL19A1Q14993 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL19A1Q14993 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL19A1Q14993 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL19A1Q14993 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL19A1Q14993 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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COL19A1Q14993 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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COL19A1Q14993 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL19A1Q14993 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL19A1Q14993 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL19A1Q14993 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL19A1Q14993 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
COL19A1Q14993 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL19A1Q14993 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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