Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPNMBQ14956 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms