Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFIXQ14938 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
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