Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SSPNQ14714 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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