Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF6Q13247 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms