Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SREBF2Q12772 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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