Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPAL4Q0D2K0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms