Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNA1Q09470 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms