Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms