Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDR1Q08345 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms