Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLEQ07864 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLEQ07864 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLEQ07864 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLEQ07864 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLEQ07864 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLEQ07864 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLEQ07864 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLEQ07864 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLEQ07864 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLEQ07864 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLEQ07864 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLEQ07864 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLEQ07864 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLEQ07864 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLEQ07864 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLEQ07864 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLEQ07864 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLEQ07864 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLEQ07864 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLEQ07864 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLEQ07864 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLEQ07864 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLEQ07864 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLEQ07864 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLEQ07864 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLEQ07864 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLEQ07864 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLEQ07864 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLEQ07864 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLEQ07864 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLEQ07864 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLEQ07864 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLEQ07864 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLEQ07864 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLEQ07864 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLEQ07864 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLEQ07864 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLEQ07864 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLEQ07864 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLEQ07864 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLEQ07864 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLEQ07864 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLEQ07864 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLEQ07864 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLEQ07864 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLEQ07864 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLEQ07864 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLEQ07864 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLEQ07864 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLEQ07864 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLEQ07864 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLEQ07864 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLEQ07864 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLEQ07864 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLEQ07864 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLEQ07864 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLEQ07864 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLEQ07864 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLEQ07864 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms