Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 AL445072.1-201ENST00000438994 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 AC005534.1-201ENST00000455709 742 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 AP001266.1-201ENST00000531155 1044 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 AC068408.1-201ENST00000577406 1144 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 AC011487.2-201ENST00000600193 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 LINC02424-201ENST00000548512 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 AC090568.2-206ENST00000521936 1469 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 AL009172.1-201ENST00000436365 1098 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNB1Q02641 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNB1Q02641 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms