Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDL3P58872 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms