Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSWP56202 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSWP56202 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSWP56202 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSWP56202 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSWP56202 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSWP56202 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSWP56202 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSWP56202 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSWP56202 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSWP56202 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSWP56202 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSWP56202 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSWP56202 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSWP56202 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSWP56202 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSWP56202 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSWP56202 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSWP56202 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSWP56202 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSWP56202 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSWP56202 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSWP56202 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSWP56202 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSWP56202 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSWP56202 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSWP56202 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSWP56202 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSWP56202 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSWP56202 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSWP56202 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSWP56202 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSWP56202 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSWP56202 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSWP56202 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSWP56202 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSWP56202 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSWP56202 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSWP56202 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSWP56202 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSWP56202 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSWP56202 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSWP56202 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSWP56202 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSWP56202 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSWP56202 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSWP56202 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSWP56202 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSWP56202 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSWP56202 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSWP56202 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSWP56202 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSWP56202 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSWP56202 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSWP56202 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSWP56202 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSWP56202 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSWP56202 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSWP56202 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSWP56202 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSWP56202 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSWP56202 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSWP56202 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSWP56202 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSWP56202 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSWP56202 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSWP56202 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSWP56202 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSWP56202 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSWP56202 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSWP56202 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSWP56202 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSWP56202 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSWP56202 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSWP56202 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSWP56202 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSWP56202 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSWP56202 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSWP56202 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSWP56202 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSWP56202 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSWP56202 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSWP56202 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSWP56202 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSWP56202 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSWP56202 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSWP56202 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSWP56202 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSWP56202 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSWP56202 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSWP56202 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSWP56202 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSWP56202 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSWP56202 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSWP56202 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSWP56202 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSWP56202 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSWP56202 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSWP56202 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSWP56202 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms