Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AQP4P55087 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AQP4P55087 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AQP4P55087 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AQP4P55087 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AQP4P55087 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AQP4P55087 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AQP4P55087 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AQP4P55087 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AQP4P55087 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AQP4P55087 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AQP4P55087 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AQP4P55087 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AQP4P55087 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AQP4P55087 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AQP4P55087 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AQP4P55087 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AQP4P55087 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AQP4P55087 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AQP4P55087 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AQP4P55087 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AQP4P55087 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AQP4P55087 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AQP4P55087 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AQP4P55087 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AQP4P55087 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
AQP4P55087 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AQP4P55087 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AQP4P55087 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AQP4P55087 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AQP4P55087 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AQP4P55087 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AQP4P55087 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AQP4P55087 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AQP4P55087 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AQP4P55087 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AQP4P55087 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AQP4P55087 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AQP4P55087 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AQP4P55087 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AQP4P55087 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AQP4P55087 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AQP4P55087 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AQP4P55087 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AQP4P55087 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AQP4P55087 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AQP4P55087 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AQP4P55087 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AQP4P55087 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
AQP4P55087 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AQP4P55087 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AQP4P55087 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AQP4P55087 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AQP4P55087 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AQP4P55087 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AQP4P55087 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
AQP4P55087 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AQP4P55087 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AQP4P55087 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AQP4P55087 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AQP4P55087 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AQP4P55087 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AQP4P55087 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AQP4P55087 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AQP4P55087 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AQP4P55087 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AQP4P55087 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AQP4P55087 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AQP4P55087 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AQP4P55087 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AQP4P55087 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AQP4P55087 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AQP4P55087 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AQP4P55087 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AQP4P55087 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AQP4P55087 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AQP4P55087 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AQP4P55087 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AQP4P55087 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AQP4P55087 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AQP4P55087 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AQP4P55087 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AQP4P55087 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AQP4P55087 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AQP4P55087 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AQP4P55087 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AQP4P55087 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
AQP4P55087 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AQP4P55087 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
AQP4P55087 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AQP4P55087 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AQP4P55087 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AQP4P55087 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AQP4P55087 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AQP4P55087 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AQP4P55087 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AQP4P55087 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
AQP4P55087 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AQP4P55087 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
AQP4P55087 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms