Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NUP153P49790 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NUP153P49790 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NUP153P49790 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NUP153P49790 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP153P49790 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP153P49790 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP153P49790 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP153P49790 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP153P49790 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP153P49790 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP153P49790 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP153P49790 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP153P49790 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP153P49790 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP153P49790 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP153P49790 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP153P49790 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP153P49790 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP153P49790 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP153P49790 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP153P49790 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP153P49790 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP153P49790 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP153P49790 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP153P49790 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP153P49790 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP153P49790 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP153P49790 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP153P49790 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP153P49790 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP153P49790 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP153P49790 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP153P49790 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP153P49790 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP153P49790 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP153P49790 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP153P49790 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP153P49790 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP153P49790 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP153P49790 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP153P49790 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP153P49790 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP153P49790 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP153P49790 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP153P49790 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP153P49790 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP153P49790 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP153P49790 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP153P49790 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP153P49790 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP153P49790 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP153P49790 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP153P49790 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP153P49790 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP153P49790 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP153P49790 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP153P49790 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP153P49790 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP153P49790 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP153P49790 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP153P49790 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP153P49790 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP153P49790 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP153P49790 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP153P49790 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP153P49790 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP153P49790 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP153P49790 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP153P49790 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP153P49790 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP153P49790 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP153P49790 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP153P49790 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP153P49790 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP153P49790 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP153P49790 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP153P49790 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP153P49790 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP153P49790 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP153P49790 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP153P49790 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP153P49790 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP153P49790 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP153P49790 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP153P49790 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP153P49790 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP153P49790 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP153P49790 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP153P49790 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP153P49790 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP153P49790 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP153P49790 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP153P49790 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP153P49790 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP153P49790 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP153P49790 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP153P49790 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP153P49790 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP153P49790 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms