Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBRP36941 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBRP36941 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBRP36941 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBRP36941 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBRP36941 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBRP36941 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBRP36941 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBRP36941 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBRP36941 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBRP36941 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBRP36941 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBRP36941 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBRP36941 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBRP36941 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBRP36941 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBRP36941 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBRP36941 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBRP36941 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBRP36941 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBRP36941 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LTBRP36941 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBRP36941 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBRP36941 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBRP36941 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBRP36941 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBRP36941 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBRP36941 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBRP36941 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBRP36941 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBRP36941 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBRP36941 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBRP36941 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBRP36941 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBRP36941 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBRP36941 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBRP36941 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBRP36941 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBRP36941 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBRP36941 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LTBRP36941 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBRP36941 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBRP36941 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBRP36941 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBRP36941 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBRP36941 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBRP36941 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBRP36941 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBRP36941 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBRP36941 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBRP36941 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBRP36941 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBRP36941 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBRP36941 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBRP36941 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBRP36941 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBRP36941 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBRP36941 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBRP36941 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBRP36941 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBRP36941 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBRP36941 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBRP36941 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LTBRP36941 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBRP36941 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBRP36941 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBRP36941 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBRP36941 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBRP36941 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBRP36941 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBRP36941 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBRP36941 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBRP36941 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBRP36941 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBRP36941 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBRP36941 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBRP36941 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBRP36941 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBRP36941 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBRP36941 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBRP36941 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBRP36941 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBRP36941 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBRP36941 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBRP36941 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBRP36941 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LTBRP36941 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LTBRP36941 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LTBRP36941 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LTBRP36941 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LTBRP36941 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LTBRP36941 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LTBRP36941 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LTBRP36941 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LTBRP36941 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LTBRP36941 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LTBRP36941 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LTBRP36941 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LTBRP36941 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LTBRP36941 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms