Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLIP1P30622 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms