Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
POLR2AP24928 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms