Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LRP5O75197 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRP5O75197 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRP5O75197 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRP5O75197 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRP5O75197 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRP5O75197 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRP5O75197 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRP5O75197 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRP5O75197 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRP5O75197 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRP5O75197 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRP5O75197 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRP5O75197 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRP5O75197 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRP5O75197 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
LRP5O75197 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRP5O75197 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRP5O75197 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRP5O75197 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRP5O75197 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRP5O75197 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRP5O75197 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRP5O75197 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRP5O75197 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRP5O75197 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRP5O75197 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRP5O75197 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRP5O75197 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRP5O75197 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRP5O75197 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP5O75197 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP5O75197 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP5O75197 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP5O75197 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP5O75197 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP5O75197 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP5O75197 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP5O75197 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP5O75197 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP5O75197 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP5O75197 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP5O75197 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP5O75197 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP5O75197 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP5O75197 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP5O75197 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP5O75197 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP5O75197 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP5O75197 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP5O75197 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP5O75197 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP5O75197 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP5O75197 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRP5O75197 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP5O75197 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP5O75197 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP5O75197 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP5O75197 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP5O75197 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP5O75197 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP5O75197 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP5O75197 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP5O75197 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP5O75197 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP5O75197 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP5O75197 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP5O75197 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP5O75197 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP5O75197 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP5O75197 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP5O75197 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP5O75197 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP5O75197 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP5O75197 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP5O75197 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP5O75197 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP5O75197 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP5O75197 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP5O75197 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP5O75197 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP5O75197 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP5O75197 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP5O75197 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP5O75197 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP5O75197 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP5O75197 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP5O75197 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRP5O75197 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP5O75197 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP5O75197 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP5O75197 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP5O75197 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP5O75197 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP5O75197 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP5O75197 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP5O75197 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP5O75197 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP5O75197 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRP5O75197 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms