Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYNGR2O43760 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR2O43760 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR2O43760 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR2O43760 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR2O43760 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR2O43760 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR2O43760 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR2O43760 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR2O43760 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR2O43760 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR2O43760 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR2O43760 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR2O43760 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR2O43760 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR2O43760 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR2O43760 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR2O43760 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR2O43760 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR2O43760 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR2O43760 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR2O43760 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR2O43760 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR2O43760 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR2O43760 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR2O43760 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR2O43760 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR2O43760 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR2O43760 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR2O43760 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR2O43760 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR2O43760 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR2O43760 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR2O43760 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR2O43760 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR2O43760 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR2O43760 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR2O43760 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR2O43760 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR2O43760 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR2O43760 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR2O43760 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR2O43760 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR2O43760 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR2O43760 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR2O43760 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR2O43760 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR2O43760 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR2O43760 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR2O43760 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR2O43760 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms